(本攻略暂时只讲主线,分支和其他任务暂时不谈,敬请原谅....)

一个无比普通的晚上,一切都显得格外平静,一个带着耳机的男孩穿越繁华的都市,他像是寻觅着什么,好象有什么在指引他一样,

坐着电车,他来到了一个车站,下站的时候,整个世界都好象停止了,时间停止在晚上12点,但面对眼前的景况,他好象不怎么惊讶,穿过一个一个犹如由馆木布置的道路后,他来到了一个类似旅馆的地方,这时候有人出来,并要男孩写上姓名(姓名是自定的,这里暂时叫做主人公吧),输入完名字后,本来在旅馆迎接的人就消失了,而这时候在墙角出现了一名神情紧张的女子,他看见主人公后,显得格外恐惧,并准备拔出腿上的枪,就在这千钧一发的时候,有另外一把声音叫停了她,叫声的主人也是一个女生,她的名字叫桐条美鶴,他向之前的女生介绍主人公这个突然转校的"转入生",而她也向主人公介绍了跋枪女子的姓名:岳羽由佳利,谈话完毕后由佳利就带主人公到他的房间......
第二天早上,由佳利来迎接主人公,并带他进入他们所就读的学校:月光馆学园.先到告示牌看看,然后到教员室报道,在里边迎接的是乌海老师,之后就会直接被带到去听校长训话了,放学的时候会有个人和主人对话,他的名字叫伊織順平,可以说是第一个与主人公主动搭话的人了,说没两句由佳利回出现,众人谈起昨天晚上的时候,伊織順平好象有些误解了.....
回到宿舍后和由佳利和桐条美鶴谈话后,就可以回到自己寝室了,这时候在下边出现了神秘的男子...第二天回到宿舍后,在客厅回遇见理事长:幾月修司.和他聊天获得一点情报,就回去寝室了..睡觉的时候,旅馆里边的人正在...而这时候...影时间开始了...

在一个奇怪的空间里边,有一个样子很奇怪的男子:イゴール,他向主人公亮出了一开始在宿舍那签定的名单,然后那个并不是什么的名单,这是一个契约!这时候イゴール给了主人公一把:契约者の键....

一觉醒来,发现自己还在寝室,之前的那一幕好象就是一个不可思议的梦一样,第二天的晚上,同样的时候,影时间继续展开,而这时候,有突发的事情,众人由监视变成了作战准备,而这时候因为战斗而受伤的真田明彦也退了回来,这次的敌人看起来很强,众人正在想对策的时候,宿舍突然发生了强烈的震动,时间无多了,看来要立刻进入战斗状态了,而这时候因为咋声把主人公弄醒了,正当想出去了解情况的时候,由佳利突然闯进,由佳利说事态严重,暂时无法解释了,说完后就给了一把小型的剑给主人公,并带他到了一楼,这时候美鶴通知由佳利敌人有一个,带着由佳利一路逃到顶楼,但没想到SHADOW竟然爬到了顶楼,由佳利拿出了之前的枪,但还没等她开枪,她的枪已经被敌人打落,这时候主人公拿起了由佳利丢在地上的枪,对着自己的头开了一枪,主人公的PERSONA:奥尔菲斯随之出现,

但亦是那一瞬间,奇怪的事情出现了,一只不知名的怪物冲破了主人公PERSONA的身躯,并迅速把SHADOW打倒,看到这一幕的其他人全部都被这一幕吓呆了,而这时候剩下的SHADOW发动的攻击,而主人公亦迎了上去!第一场战斗展开,敌人都不强,可以熟悉一下系统,不过暂时就只能使用四个选项......战斗完毕后,主人公可能因为消耗过多而倒下了.....回到梦中,主人公又回到那个神秘的房间,他告诉主人公力量已经觉醒了,因为消耗过多你昏迷过去了,但不用担心,在イゴール身上了解一些情报过后,主人公又离开了那个房间....

醒来后发现自己在医院,而由佳利就守在旁边,见到主人公没事,由佳利也松了一口气,主人公说起了昨天晚上发生的事情,由佳利把有关的事都说了一下,然后就离开了....18日放学回到宿舍,一路跑到上四楼会遇到由佳利,之后由佳利就会带主人公去开理事长处,在众人口中得知这个世界上有隐藏着的时间,这个一日与另一日狭间的时间叫影时间,影时间每天晚上一到12点就会展开,普通的人不会感觉到影时间的存在,而他们也会进入棺木中休眠,而之前所看见的怪物,就叫做SHADOW,而为了消灭SHADOW,理事长成立了特别特外活动部,加入到特别活动部后,美鶴给主人公派出了召唤器....

晚上,影时间展开的时候,主人公房间出现了之前在柜台遇见过的那个迷之少年,他和男主角说了一些摩不着头脑的话就消失了,到了19日的晚上,这时候明彦告诉众人有新成员加入,众人还在猜想新人是谁的时候,没想到进来的竟然是伊織順平.....20日的午休的时候,美鶴跑到三人的课时通知三人今天晚上需要集合,到了晚上,众人集合开作战会议,今天晚上就得去SHADOW的巢穴,之后到达学校,想不到平时充满快乐气息的学校到了影时间的时候竟然变成了一个巨大的迷宫,进去后美鶴作为情报员离开队伍,并且确立了主人公为队长,正当众人准备上去的时候,主人公发现了旁边的一对发光的门,用之前获得的契约者之键把其打开,果然在里边遇见了イゴール,他再给了一些情报给主人公后,主人公就离开了,这里开始可以打开菜单,与队员谈话可以调查和更换队员装备,准备完毕后就可以到上边的入口了,去到有敌人的位置前美鶴会告诉你,所以不用担心突然被攻击,而遇敌人的方式是你用剑攻击敌人或者敌人碰到你,战斗过程中,你只能控制主人公一个,而其他同伴可以通过命令来驱使他们行动,而在战斗后有机会可以抽卡片,可以抽到新的PERSONA,当然抽不到也可以回复体力等等,注意收集到PERSONA后也可以到イゴール那里合成,注意在迷宫里一到了出口就不能再进去了,所以要收集的就要注意地图显示了.