第十一关：地铁镇subway town

回到水源镇和上尉见面后，上尉认为呆在水源镇已经不安全，因此设置了通讯干扰装置后和玩家乘坐热气球赶到抵抗组织的基地地铁镇（subway town），地铁镇位于新月城（crescent city）的废墟下面。在途中他告诉玩家本来政府已经对以前小行星撞击地球做好了准备，但柯若思将军（general cross）在很多方舟里放入了他的士兵，改变了最初的计划，抵抗组织的任务就是恢复原来政府的计划。来到地铁镇后上尉大致介绍了一下情况，上尉原来乘坐的方舟已被罗萨德（lassard）改装成行动中心的主机，可以监视权威的行动，基地里的杰克•波特曼（jack portman，胸口有个**的那人）是军火专家，所罗（saul）在镇里经营车库，为基地打掩护，镇长红石（redstone）是个笑面虎，同时和权威、抵抗组织打交道，经常出卖别人，但为了对付权威，又必须赢得此人的信任。玩家接手的第一个任务就是和红石打交道，成为他的左右手。从基地左侧的通道过去，乘电梯来到车库，出去以后到地铁轨道对面，登上楼梯，红石的办公室就在边上，外面有个看守，进去后红石让玩家去帮弗曼•琼斯（foreman jones）对付变异人，临走前把红石办公桌左边的木偶拿走，到楼上另一面的商店里去见简妮（jani），她手里拿着个棒棒糖，头上戴个印着粉红骷髅的钢盔，口气略带挑逗及撒娇感，在她那里先把以前带来的货物处理一下，买一些弹药，楼上另一个上锁的房间可用工具打开，里面的矿石也能卖些钱。楼下霏滋酒吧（fez bar）里的店主（brick）由于强盗影响了他的送酒路线，因此每摧毁一辆强盗的车子就能获得回报，摧毁权威的捕食者赏金加倍。 22:50 2011/10/5

第十二关：蓝线站the blue line station

从红石办公室下来后从左下角进入地铁，转弯不久就看到弗曼•琼斯，他说正在四处扩张的变异人挖入了蓝线站，他想要玩家去阻止变异人的扩张势头，接受任务后从车库出地铁镇，跑到镇外的大桥下面进入蓝线站，穿过走廊和车厢，到处是地铁员工的尸体，变异人来回奔跑，经过几道铁闸门跑到楼上的一个箱子那里拿到炸药包后身后的栅栏关闭，许多变异人爬上二楼大肆进攻，最好用霰弹枪应付。成功后栅栏再度打开，干掉一些拿着燃烧瓶的变异人后来到楼下，办公室的大门会被一人撞开，进入这个被烧毁的网吧后看到一节地铁车厢嵌在楼层中。经过车厢出来到地铁楼梯中央的大厅再次遭到大批变异人围攻，穿过破损的厕所一路来到候车厅，那里除了近战变异人外还会遇到一个持火箭筒的巨型变异人，先在运动中把近战类步兵解决，然后用手雷或狙击枪击毙火箭筒兵。从他驻守的**过去，进入后面的甬道，身后的铁栅栏会自动关上，沿甬道杀过一段距离后在坑道里找到安放炸药的四个地方（找不到的话可以留意地下的引爆线），然后绕到对面按下引爆器，炸毁坑道后出现两个长着触手的巨型变异人和大批步兵，先用手雷炸死巨型变异人，剩下的用霰弹枪对付，消灭后引爆器后面的车厢门打开，通过以后回到蓝线站出口。