芯片系统(3代):将Zero的身体分为头部、身体、脚步等部位而可以安装不同功能的芯片,来强化Zero的基础能力,根据不同部位设置的不同芯片,Zero的能力也有很大差异,最为经典的2段跳技能也在3代起重新复活。
芯片强化系统(4代):根据3代而来的强化零件系统,玩家可以通过夺取敌人的特殊芯片来自己制作各种零件,增大了收集的乐趣。
天气系统(4代):将关卡内的天气进行变换来改变关卡的攻略难度,例如在一些关卡中晴天下会没有什么问题,但阴天下就会看不见地面,或者是部分关卡在特殊天气下会有巨风、磁场等特殊影响,阻碍前进。天气系统可以说是另类的调整游戏难度的系统,但天气系统会影响关底EX技能的获取,和评价要素。