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　　行动篇
　　不可思议最大的特色之一就在与其独特的行动系统“半回合制”。
　　所谓的“半回合制”就是指在迷宫中，敌我的行动可以说是同时进行的，通俗的说来就是我方在作出行动的同时敌人也在行动。在敌我完成一次行动之后，一个回合结束，新回合开始，这一流程由电脑自动完成。在每个回合中，迷宫中的所有行动单位都一个基本的行动点（一些怪物拥有两个）。对于我方来说，所有的行动都要消费一个行动点（命名、书写指令除外），特殊情况下可以令自己在一回合中拥有两个行动点（加速）或两个回合才有一个行动点（减速）。
　　在同一回合中，敌我单位也有不同的优先级。我方的优先级是高于敌方。例子就是在同一回合的两个临近单位，回合中同时进行攻击指令，攻击顺序是我方->敌方。这是我方在行动上的优势。
　　在全部的系列里，一般a+b同时按下为消耗一个回合（不做任何行动，同时hp进行微量恢复），长按为加速回合流动。这一操作的作用是很有用的。可以对现有的敌我布局进行调整，消除一些对自己不利的行动。但是每曾迷宫都有自己的回合限制，当玩家在该曾迷宫消耗的回合到达一定数字后，会被强行踢出迷宫（限定回合到来前的数个回合会有提示），所以不能在同一层待得太久。

　　移动篇
　　迷宫中，所有单位的移动是类似棋类的移动方式，不同的是追加了斜向的移动。就是说我方可以向周围的8格中的任意一个进行移动。
　　现在插讲一个不可思议迷宫的重要特色系统：满腹度。我方在处于迷宫的同时，每几回合都要进行满腹度的扣除（初始值100），当所有的满腹度被扣光后，开始扣除玩家的hp（每回合扣1），归零后饿死。
　　满腹度系统的存在，意味这玩家不能在迷宫中肆无忌惮的任意行动。虽然满腹度可以通过一些手段进行恢复，但是有经验的玩家也会对移动进行规范以节约满腹度的开销，最基本的规则就是尽量进行两点间的直线移动多走斜线。一般的说来，游戏都会安排某个按键（Ｒ键），在按死该按键的时候，玩家就只能进行斜方向的移动。

　　迷宫篇
　　随机生成迷宫系统，这就是数以万计的玩家为之痴迷的系统，每次进入迷宫，迷宫的形态都与上次不同，地形、敌人配置、陷阱、出口设置都是不同的，这是真真正正的迷宫！对于玩家的任务，就是找到每层迷宫的出口，进入下/上一层。
　　地形的随机性提高了地图的重要性，随时确认自己所在的地点，对玩家是非常重要。迷宫不外呼是由两个部分构成：房间和连接房间的通道。玩家进入房间，就能把视野扩大为整个房间（通道里的视野只有周围的8格）。只有在视野范围内的怪物和道具才能被发现。通道的视野不佳，但是却是保命的重要场所，以后会说到。但是房间和通道的壁是可以破坏的（破墙系的武器、引发爆炸或是阅读大部屋卷物），但是就算把通道破坏成如房间一样也不会扩大视野。有时候会碰到整曾迷宫都是一个大房间，这种情况对等级和道具不充足的玩家是很危险的，因为所有的敌方单位都会把玩家设定为攻击对象，此时若是能力不足的玩家的首选是尽快脱离本层。
　　陷阱在迷宫中是不能被玩家发现的，但是可以通过吃明眼草发现全层的陷阱，或者是对认为是有陷阱的地方进行挥空攻击。迷宫中还会有其他的地形设置如水塘，水晶。水塘一般是无法通过的。但是可以装备特殊的指轮以实现在水上的行走；水晶可以反射魔法，对一些有利效果的杖，可以利用水晶将效果反施到自己身上，如对水晶挥动+血杖，或对水晶挥动瞬移杖脱离险境。
　　相对于新手来说，等级是很重要的，等级关系到玩家的hp和攻击力，以一般性规则来说，前期玩家等级与所在层数的的差为2以上时，是比较安全，但是这个规则在后期是不适用的，等级的提升是没有层数涨得快的。

　　初心生存手册
　　不可思议迷宫的特色是在迷宫中不幸阵亡的话，身上的所有道具会丢失，重新游戏玩家等级归1，这样的设定给人的心理压力是可想而知的。新出的救助系统可以通过其他玩家的救助，从阵亡处复活，这一定程度上缓解了压力。但是迷宫中危机重重，最后依靠的还是自己。

　　生存手册一：收集食物。新手进入迷宫一般不会控制满腹度的开销，最后因找不到食物而饿死。以新出的风来ds来说，最好的解决方案是：在第一村落的酒馆，每次从迷宫回来与柜台的老板对话可得到一个大饭团，进入第一层迷宫后，找到出口，选回到上层（第二项），回到村庄拿大饭团……用这样的方法来保证温饱，带足干粮再上路。迷宫有种陷阱是会把玩家身上的食物变腐坏，变坏的食物也可以进食，但恢复效果不如原来，而且附带不良效果（吃这种东西能好吗！）。陷阱的效果对壶中的东西无效，所以，食物最好都存到身上的保存壶里。在困难时期也不要把坏的食物丢掉，因为不良效果只在本层有效，所以可以这样利用：站到出口上>吃东西>到下一层。这样的方法也可以用来检验未识别的草类，草类只有在吃了后才能识别。另外，吃草也可以恢复满腹度5点。