主角和搭档继续着修行，突然有一天胖可丁宣布他们可以毕业了～接着胖丁告诉了他们关于进化的地点，这里也是毕业考试的地方，在しんぴのもり（神秘森林）有着ひかりのいずみ（光之泉），不过看起来有强敌等待呢？到宝物镇发生剧情遇到二熊，之后就可以出发去新迷宫了。
迷宫しんぴのもり
层数：13F
BOSS：胖丁+音符鹦鹉+向日葵+地鼠+风铃铃+毒蟾斗士+三地鼠+龙虾小兵+重音怪
通过后掉入陷阱，黑暗的“大魔王”正在恐吓时，突然亮了，一看，靠，居然是行会的那群家伙……
不过这次真的是大危机……风铃铃的呵欠，胖丁的唱歌和封印……胖丁的HP700左右，打不过他就别想进化了……
大魔王失败了！大家逃啊！一群乱七八糟的家伙……
进入森林，主角预感到那东西居然是胖可丁放在那里的？打开一看……原来是……胖丁最喜欢的食物……
这时光之泉出现，剧情以后就可以进化了！
◎进化说明：此后在迷宫列表中会出现ひかりのいずみ，前往后会询问是否进行进化，然后会出现已经满足条件的怪兽列表（全部怪兽，包括队伍里的和非队伍里的），然后只要选择让哪只进化就可以进化了～很简单的系统～
不过……主角和搭档无法进化！因为他们经历了时空扭曲的缘故！
（要使主角进化必须满足三大条件：1、完成了2周目剧情；2、捕捉了珍珠·钻石兽；3、玛纳菲回归并且发现新迷宫）
毕业成功！庆祝！此后房间变成了鲨鱼岩上的那个洞穴里的床，记录也是这里，不要再走错了～
之后风铃怪会告诉主角们可以换队长了，哦也，终于成为自由的探险队了～
◎转换队伍首领的方法：在风铃怪处选择なかまをみる，蓝色的是队长，黄色是队员，白色是非队员，对于白色的，选择“チームにさんか”加入队伍成为黄色，对于黄色的，选择“リーダーにする”成为队长变成蓝色，OK。不过874一下，地图屏幕上显示的仍然是主角跟搭档……
四个新迷宫出现：ゼロのしまほくぶ、ゼロのしまとうぶ、ゼロのしませいぶ、ゼロのしまなんぶ（零之岛北东西南部），这几个迷宫进入后打到怪兽不会获得经验值……
以下触发条件不明，是否有先后顺序不明（应该是先后顺序）：
机密等级
一天在变色龙商店右边看到吸盘魔偶，对话后新迷宫出现，
ふぶきのしま（暴风雪之岛）19F无BOSS
突破后紧接着出现新迷宫
クレバスのどうくつ（雪缝洞穴），9F+4F，BOSS雪女
救出钢铁螳螂以后收到谢礼『シークレットランク（机密等级？）』
玛娜菲之蛋
一天与行会里的向日葵对话，得知とざされたうみ（封闭之海）的事情，新迷宫开启。
とざされたうみ（封闭之海），20F，获得3个宝箱+1个神秘的蛋
第二天蛋孵化了，果然是玛娜菲……去找音符鹦鹉鉴定完毕后得到消息要去えんがんのいわば给小玛娜菲找特定的食物あおいグミ了。
当然如果你的身上或者仓库里有あおいグミ或者碰巧可以买到あおいグミ的话就不用去哪个迷宫找了～
把あおいグミ带着跟玛娜菲说话，小家伙高兴了～以后就一起生活吧～到迷宫里去再找些あおいグミ喂它……难道是宠物设定么……
再喂一个あおいグミ就可以带着玛娜菲出去散步了，带着它来到海岸，但是当天晚上，玛娜菲就消失了……第二天着急的他们在行会门口遇到鹦鹉，然后来到海岸，终于找回玛娜菲，但是玛娜菲病了……鹦鹉告诉两人，需要找到海之精灵菲奥奈才能治好玛娜菲，他们就在きせきのうみ（奇迹之海）。新迷宫出现。
きせきのうみ（奇迹之海），18+4F，BOSS暴鲤龙
帮菲奥奈赶走了暴鲤龙，获得谢礼フィオネのしずく（菲奥奈的水滴），拿回去发生剧情玛娜菲就好了～不过为了它能健康快乐地生活，只能强行让他回到海里去生活了……痛苦的离别……
三圣柱、圣柱王与藏宝之地的秘密
一天来到行会，在地下二层看到大家正在围着三位美女欢呼，原来是有名的又强大又美丽又漂亮又可爱的明星宝物猎人三人组“チャームズ”来了——瑜伽王，女郎兔和超能女皇。原来他们与行会老板胖可丁在很久以前一起探险过，相互是朋友。不过这次他们不是来叙旧的——曾经完全不知道什么用途的特殊道具カギ的作用终于探明了，打开ばんにんのどうくつ（看守的洞穴）的道具，据说在那里沉睡着巨大的宝藏！不过胖可丁却说自己忘记了……可是当三人拿出胖可丁最喜欢的食物时它又说想起来了！回房一阵巨响后找到了！那么大家一起去探险吧！新迷宫开启。就在大家议论着“チャームズ”重出江湖时，却同时知道了另一个消息：传说中的最强探险队レイダース——エルレイド，ロズレイド，ドサイドン三人组。
ばんにんのどうくつ（看守的洞穴），3F循环×2/4F循环+5F，BOSS三圣柱+钢人4只沙瓦郎4只+圣柱王。
这个洞穴里出现的基本上全部是安农，在迷宫中打倒安农，就用几率获得对应字母的石头，根据各段石板上的字母集齐对应的字母石头后调查石板，就能够打开通路——打开通路时石头会消失。
第一段的石板上是“ICE”，当集齐I,C,E三个字母的石头后，通过3F回到入口处调查石板，冰神柱入口出现；
第二段ROCK，岩圣柱；
第三段STEEL，钢圣柱。
注意，该迷宫一旦使用穿墙玉之类的出去重新进来，就要重新与圣柱战斗。
钢圣柱倒地后，被打倒的チャームズ三人组出现，继续前进。到达最深处，与圣柱王和其率领的部下战斗。
战胜圣柱王后红色石板出现，启动圣柱王机关，宝藏之地かくされたいせき（隐藏的遗迹）开启。
かくされたいせき（隐藏的遗迹），30F，最底层是6个宝箱，无BOSS
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